3、进一步修正和细化一般纳税人的认定条件，控制专用发票使用的龙头。现行增值税一般纳税人的认定条件略显粗糙，缺乏可操作性，企业可以通过各种方法，取得增值税专用发票的使用资格。因此，税务机关应加强对一般纳税人的计定和年检，对不符合条件的单位，坚决不予或取消一般纳税人资格。建议应进一步修正、细化一般纳税人的认定条件，重点放在企业的建帐制是否规范上，同时将“年增值税税负率”是否达到或接近行业平均水平作为重要的衡量标准。对税收负担达不到一定正常水平，又无正当理由的企业，应取消一般纳税人资格，停止专用发票的使用。
4、强化“市场”税收管理，是控制发票问题的重点。目前，增值税专用发票的问题有相当大的一部分产生于各地为某种物资流通而设立的集中性的交易场所或交易市场及出租柜台的商场商店。鉴于目前“市场”税收的体外循环及增值税发票的失控情况，建议有关部门对“市场”进行一次全面地清查整顿，取消包税行为，以经营单位进行资格审定，符合一般纳税人条件的才给予增值税专用发票和使用资格。对商业部门要研究具体办法，解决其不开售货发票或少开售货发票、实行回扣等偷漏增值税的行为。
5、加强现代化征管手段建设和稽核检查制度建设。计算机征管和稽核可以大大提高征管工作质量和效率。要创造条件，加快计算机联网建设，从而加强计算机稽核。建议国家税务总局和各地税务部门继续重视和加强计算机的征管和稽核，加快“金税工程”建设，并组织专家设计和完善相应的软件，扩大联网面，对于一定数额以上的抵扣联必须进机交叉稽核，有问题的立即进行人工稽核，对纳税人购、用、存以及纳税申报全部纳入计算机管理，以减少发票管理与税收证管相脱节的现象。
税务稽查和征管有同等重要地位，有必要充实稽核和检查队伍的力量，增加人员，同时提高稽查干部的政治和业务素质。还要增加资金投入，改善交通、通讯等稽查工具和办公设施，扩大计算机稽查范围。
6、注重专用发票外部管理，帮助和监督企业建立专用发票控制制度。专用发票管理“链”，是由税务机关和纳税企业共同构成的，但目前实践中却忽视企业对专用发票的管理，形成管理“链”的脱节。重大增值税专用发票犯罪案件绝大部分是在企业从税务机关领取专用发票以后发生的；另外，由于企业对发票管理不善而造成的遗失情况也不断发生，因此，切实加强企业对增值税专用发票的管理己刻不容缓。企业应建立对外来专用发票形式审核制度、实质审核制度和定期报验制度。对企业专用发票应建立专人管理、专人使用、专项填报、日常检查、定期报查等制度，税务机关要帮助企业建立外部专用发票和本企业专用发票的控制管理制度，并监督企业的执行情况。对控管制度建立不全或执行不严的可根据有关规定予以处罚。如企业因审核不严而收进虚假专用发票，税务机关要坚决不予抵扣。对遗失发票的也可给予严肃处理，并采用累计计分的办法，对违章超过一定次数的，给予停发专用发票等处罚。
7、制定严厉的罚则，加大打击力度。一个国家和地区的偷税行为是否经常发生，除了公民纳税意识是否增强外，主要取决于两个因素：一是偷税被查出的可能性，二是对偷税行为的处罚程度。由于部分纳税人感到偷税被查出的可能性不大，即使查出来处罚也不严，所以唯利是图者就会挺而走险。因此，税务部门要积极争取当地党政部门和公、检、法、银行、审计等部门的密切配合，共同打击偷逃税收的犯罪行为。对情节恶劣者除刑事处罚外，还要通过舆论“曝光”，以起到教育全社会的作用。另外，对一般纳税人建立违章登记制度，超过一定次数的，取消或停供发票。因主观原因造成的发票遗失的必须严厉处置，对造成严重后果的要负连带责任。
